Alla fine del XXI secolo, il mondo è afflitto da un misterioso virus e da condizioni meteorologiche insolite. La geniale scienziata Dottoressa Kisaragi crea un androide con il nome in codice "Cutie Honey" (Mariya Nishiuchi). L'androide è unico in quanto possiede emozioni umane. Per salvare l'umanità, Cutie Honey si scontra con un'organizzazione malvagia.
